这两种设备经常被混用，但防护方向完全相反。
洁净工作台（超净台）是向外吹洁净空气，保护样品不被环境污染，风向是从操作区吹向操作人员，适合做无菌细胞培养、微生物接种这类只保护样品的操作。生物安全柜是向内吸风，把操作区气溶胶吸入经过高效过滤后排出，保护操作人员和环境不被样品污染，适合处理病原微生物、危害药品。
搞反了后果很严重：如果在洁净工作台里操作致病菌，气溶胶直接吹到操作人员脸上，造成职业暴露；如果在生物安全柜里做无菌样品，柜内向内吸的风会把周围脏空气带进来，样品被污染。
选型按操作对象定：保护样品选超净台，保护人选生物安全柜。A2型安全柜循环百分之七十、外排百分之三十，B2型全外排。
使用前开机自净15分钟，操作口风速每年校准一次。
