保健品车间介于食品和药品之间，按保健食品良好生产规范设计。
直接入口的片剂、胶囊、口服液灌装区按三十万级洁净，比药品的D级（十万级）宽松一档；原料预处理、外包装、仓储按一般生产区。
压差上洁净区相对非洁净区正压10帕，不同洁净等级之间相差5帕。温湿度按产品要求定，片剂车间湿度低于百分之六十五，防止吸潮。
和药品比，保健品车间不需要做无菌灌装，不需要B级背景下的A级层流，验证也从简，不需要完整的VMP文件体系，但人员更衣、物料净化、微生物监测这些基础要求一样不少。车间布局上人物流分开，原辅料从外清间进入，成品从另一侧出口，避免交叉。
设备材质304不锈钢，CIP在线清洗优先。
